自動進樣器進樣時常常扎彎進樣針或進樣針推桿。原因分析及解決辦法：
1.進樣隔墊上的螺母擰得過緊，隔墊在高溫時膨脹更緊，使得進樣針難以扎進弄彎針頭，擰隔墊螺母不應擰得過緊，隨著進樣口溫度升高，進樣隔墊膨脹自然會密封良好，既防止了針頭扎彎，又能增加隔墊使用次數。
2.進樣針安裝不正確造成進樣口扎在其它部位，按要求正確安裝進樣針。
3.進樣針管內被污染，由于污染物造成推桿活動阻塞弄彎推桿，進樣針使用一段時間后，特別是在重新開機前，應取下進樣針，用手推進樣針桿，感覺是否順暢，若有阻塞感，應吸入溶劑反復推拉清洗，若污染物仍不能清除，可將推桿拉出，同針管一起放入溶劑中超聲清洗。
4.進樣樣品粘稠度過大，造成針桿難以推進。可以重新對樣品凈化處理或稀釋進樣樣品或選用緩慢進樣模式，若問題不能解決，則需要選用專用進樣針或其它進樣方式。
進樣墊漏氣或者損壞：
1、隔墊的設計是為了在進樣針穿刺后時、進樣時及其拔出后，始終保持對系統的密封性。因此就需要采用能耐一定溫度和壓力的橡膠或塑化材料以保證這種良好的密封特性。
2、但這種材質的隔墊隨著時間的推移和一定的進樣次數后，就會老化甚至漏氣，達不到進樣密封的要求。
3、有些情況下，當氣相色譜儀進樣墊老化損壞后，由于其密封性能下降，使載氣柱前壓無法達到設置要求，出現一系列問題，有些較為先進的儀器還會自動關閉。
4、進樣墊漏氣會導致一些列問題，這將導致一些典型的問題比如定量重復性較差，分析樣品的保留時間變化（增長）。所以進樣墊應該定期檢查及更換，有些色譜工作者會在每次進行新的樣品分析前先更換一個新進樣墊。
