液相色譜儀屬于高精度、比較貴重的分析測量儀器。它的更新速度較快，要求檢驗人員掌握較高的專業操作技術，因此在檢驗中要認真仔細，多加思考，不斷總結經驗教訓，在工作中邊檢邊學，逐步提高檢驗水平，提供準確可靠的檢驗結果。在日常使用中必須由專業技術人員嚴格按照相關的操作規程來使用，以免不正規的操作造成檢驗結果失準或者儀器損壞。
液相色譜儀啟動前的檢查
1、流動相的制備要與裝置相適應
流動相必須經過過濾再送液泵內。為了防止雜質和顆粒進入流路，要裝有0.45um的吸濾器，否則會導致流路污染，使儀器工作不正常。
(1)流動相恢復到室溫后使用：流動相溫度與室溫相差時容易產生氣泡，導致儀器基線很難穩定，特別是發生漂移后，一定要使流動相恢復到室溫后再使用。
(2)流動相務必進行脫氣：使用液相色譜儀時遇到的麻煩就是流動相產生氣泡這會引起泵輸液不暢和檢測器產生噪聲和漂移。
(3)檢查溶劑瓶內吸濾器是否堵塞：溶劑的質量或微生物的生長會堵塞吸濾器，從而影響液相色譜系統的正常運行。
有效防止液相色譜儀吸濾器堵塞的方法：①若需使用含鹽的流動相，使用前務必過濾；②流動相若為蒸餾水或含鹽的緩沖液，建議現用現配；③盡量避免溶劑瓶在陽光下暴曬。
液相色譜儀吸濾器堵塞后的處理方法：①取下吸濾器濾頭，放在(1：4，v/v)硝酸溶液燒杯中超聲清洗15min；②取出后用蒸餾水超聲清洗10min；③用吸耳球吹出過濾頭中的液體；④再換蒸餾水超聲清洗10min；⑤用吸耳球吹出過濾頭中的水分：將吸濾器濾頭重新放入溶劑瓶中(正相系統注意將吸濾器濾頭烘干再使用)。
(4)更換流動相時應注意的事項：
①更換有互溶性的流動相時：a.將吸濾器部分放入準備更換流動相的燒杯中邊震動邊清洗，更換燒杯中的流動相直至清洗干凈；b.打開排液閥，按清洗鍵清洗泵中的流動相；c.然后將吸濾器部分再放入流動相瓶內，關閉排液閥，在較短時間內清洗流路；d.最后連接柱和檢測器，清洗整個分析流路。
②更換無互溶性的流動相時：準備與新舊流動相具有互溶性的中間清洗液。首先換成中間清洗液，然后再把中間清洗液換成新的流動相。每次更換順序都要遵循前述的a-d的順序。
③更換緩沖液的流動相時：在新舊流動相的任一方或雙方使用緩沖液時，準備蒸餾水做中間清洗液。首先用蒸餾水置換整個流路，然后更換成新的流動相，防止緩沖液中的鹽析出。
2、輸液泵的檢查
(1)如果液相色譜儀進液管內不進液，使用注射器吸液：發現進液管內不進液或有大氣泡時，打開排液閥，用注射器從排液管中吸液；若空氣量太大，有時用泵的清洗功能也無法徹底清除空氣。
(2)通常在液相色譜儀輸液前進行流動相的清洗：例如，停機夜間的溫度與白天相差大時，或幾天未開機時，有時在泵頭內會產生氣泡，如果不清除就輸液，會由于氣泡不能脫出而造成輸液不暢。因此，需進行5min的清洗，以便排出氣泡。
3、六通閥的檢查
(1)樣品溶液進樣前必須用0.45um濾膜過濾，以減少微粒對進樣閥的磨損。
(2)轉動閥芯時不能太慢，更不能停留在中間位置，否則流動相受阻，會使泵內壓力劇增，甚至超過泵的最大壓力，再轉到進樣位時，過高的壓力將使柱頭損壞。
(3)為防止緩沖鹽和樣品殘留在進樣閥中，每次分析結束后應沖洗進樣閥，通常可用水沖洗，或先用能溶解樣品的溶劑沖洗，再用水沖洗。
4、自動進樣器的檢查
(1)確認清洗液：自動迸樣器的清洗液，請使用與流動相相同的液體，但是含鹽分時必須清除鹽分。另外，清洗液在六通閥內與流動相接通，這時須注意鹽分不要析出(鹽的析出是造成堵塞的原因)。
(2)清洗液脫氣：自動進樣器的清洗液，也是封入在樣品計量部分的溶劑，其在連續運轉時會產生氣泡導致誤差，必須使用脫氣裝置進行脫氣。
(3)必須凈化清洗液：例如，停機夜間的室溫與白天相差較大時，或幾天未開機時，清洗液的流路中會產生氣泡，如不除去氣泡就進行分析，進樣量會產生偏差，因此，在等待基線穩定的時間內，應進行清洗，排出氣泡。用吸液器從排液器徹底吸引(啟動注水)后，關閉排液，進行清洗。
液相色譜儀是分離分析技術的核心，對我國食品檢驗的工作起著非常重要的作用。因此，我們要加大對液相色譜儀使用和注意事項的重視，保證食品的質量安全。
